Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXO28Q9NVF7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXO28Q9NVF7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXO28Q9NVF7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXO28Q9NVF7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO28Q9NVF7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO28Q9NVF7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO28Q9NVF7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO28Q9NVF7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO28Q9NVF7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO28Q9NVF7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FBXO28Q9NVF7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FBXO28Q9NVF7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FBXO28Q9NVF7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXO28Q9NVF7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO28Q9NVF7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO28Q9NVF7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms