Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX7

RNF146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF146Q9NTX7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF146Q9NTX7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF146Q9NTX7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF146Q9NTX7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF146Q9NTX7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF146Q9NTX7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF146Q9NTX7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF146Q9NTX7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF146Q9NTX7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF146Q9NTX7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF146Q9NTX7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF146Q9NTX7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF146Q9NTX7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF146Q9NTX7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF146Q9NTX7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF146Q9NTX7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF146Q9NTX7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms