Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT82Q9NSB4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT82Q9NSB4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT82Q9NSB4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT82Q9NSB4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms