Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE7BQ9NP56 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE7BQ9NP56 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE7BQ9NP56 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE7BQ9NP56 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE7BQ9NP56 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE7BQ9NP56 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE7BQ9NP56 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE7BQ9NP56 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE7BQ9NP56 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE7BQ9NP56 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE7BQ9NP56 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE7BQ9NP56 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE7BQ9NP56 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE7BQ9NP56 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE7BQ9NP56 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE7BQ9NP56 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE7BQ9NP56 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE7BQ9NP56 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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