Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVK-5Q9HDB9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms