Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOX17Q9H6I2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX17Q9H6I2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms