Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5V8

CDCP1, CUB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCP1Q9H5V8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCP1Q9H5V8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCP1Q9H5V8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms