Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CIPCQ9C0C6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIPCQ9C0C6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIPCQ9C0C6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms