Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RNF17Q9BXT8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
RNF17Q9BXT8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RNF17Q9BXT8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RNF17Q9BXT8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RNF17Q9BXT8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RNF17Q9BXT8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RNF17Q9BXT8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RNF17Q9BXT8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RNF17Q9BXT8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RNF17Q9BXT8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RNF17Q9BXT8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
RNF17Q9BXT8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RNF17Q9BXT8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RNF17Q9BXT8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RNF17Q9BXT8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RNF17Q9BXT8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RNF17Q9BXT8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RNF17Q9BXT8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RNF17Q9BXT8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RNF17Q9BXT8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms