Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCM2Q9BSQ5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms