Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RIOK1Q9BRS2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RIOK1Q9BRS2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms