Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX50Q9BQ39 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX50Q9BQ39 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms