Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPS6KC1Q96S38 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPS6KC1Q96S38 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms