Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN2

NLRP4, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP4Q96MN2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NLRP4Q96MN2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP4Q96MN2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP4Q96MN2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms