Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDXPQ96GD0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDXPQ96GD0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms