Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP3Q96DZ5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLIP3Q96DZ5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP3Q96DZ5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP3Q96DZ5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP3Q96DZ5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP3Q96DZ5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIP3Q96DZ5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP3Q96DZ5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP3Q96DZ5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP3Q96DZ5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP3Q96DZ5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP3Q96DZ5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP3Q96DZ5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIP3Q96DZ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms