Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PABPC5Q96DU9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PABPC5Q96DU9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PABPC5Q96DU9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PABPC5Q96DU9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PABPC5Q96DU9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PABPC5Q96DU9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PABPC5Q96DU9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PABPC5Q96DU9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PABPC5Q96DU9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PABPC5Q96DU9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PABPC5Q96DU9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PABPC5Q96DU9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PABPC5Q96DU9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PABPC5Q96DU9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms