Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC102AQ96A19 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC102AQ96A19 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC102AQ96A19 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC102AQ96A19 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms