Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOP1MTQ969P6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP1MTQ969P6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOP1MTQ969P6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms