Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX19Q92543 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX19Q92543 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms