Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APPL2Q8NEU8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
APPL2Q8NEU8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APPL2Q8NEU8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APPL2Q8NEU8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APPL2Q8NEU8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APPL2Q8NEU8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APPL2Q8NEU8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APPL2Q8NEU8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms