Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AVL9Q8NBF6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AVL9Q8NBF6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms