Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC89Q8N998 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC89Q8N998 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms