Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUZ0

LRRC49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC49Q8IUZ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC49Q8IUZ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC49Q8IUZ0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC49Q8IUZ0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC49Q8IUZ0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC49Q8IUZ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC49Q8IUZ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms