Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y37

CACUL1, CDK2-associated and cullin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACUL1Q86Y37 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACUL1Q86Y37 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACUL1Q86Y37 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACUL1Q86Y37 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACUL1Q86Y37 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACUL1Q86Y37 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACUL1Q86Y37 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACUL1Q86Y37 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACUL1Q86Y37 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACUL1Q86Y37 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACUL1Q86Y37 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACUL1Q86Y37 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACUL1Q86Y37 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACUL1Q86Y37 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACUL1Q86Y37 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACUL1Q86Y37 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACUL1Q86Y37 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACUL1Q86Y37 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACUL1Q86Y37 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACUL1Q86Y37 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACUL1Q86Y37 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CACUL1Q86Y37 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACUL1Q86Y37 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACUL1Q86Y37 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms