Protein–RNA interactions for Protein: Q86X52

CHSY1, Chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1Q86X52 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHSY1Q86X52 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHSY1Q86X52 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms