Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3D4

LYSMD3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD3Q7Z3D4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LYSMD3Q7Z3D4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYSMD3Q7Z3D4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156 ms