Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
OTOP3Q7RTS5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms