Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARCQ7LC44 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARCQ7LC44 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARCQ7LC44 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms