Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KNDC1Q76NI1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
KNDC1Q76NI1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KNDC1Q76NI1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.8■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms