Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCM7

SLC25A25, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A25Q6KCM7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A25Q6KCM7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A25Q6KCM7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A25Q6KCM7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A25Q6KCM7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A25Q6KCM7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC25A25Q6KCM7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC25A25Q6KCM7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC25A25Q6KCM7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms