Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPX1

TBC1D3C, TBC1 domain family member 3C, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBC1D3CQ6IPX1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBC1D3CQ6IPX1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBC1D3CQ6IPX1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBC1D3CQ6IPX1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBC1D3CQ6IPX1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D3CQ6IPX1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TBC1D3CQ6IPX1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBC1D3CQ6IPX1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms