Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CARMIL1Q5VZK9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CARMIL1Q5VZK9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CARMIL1Q5VZK9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CARMIL1Q5VZK9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CARMIL1Q5VZK9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CARMIL1Q5VZK9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CARMIL1Q5VZK9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CARMIL1Q5VZK9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CARMIL1Q5VZK9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CARMIL1Q5VZK9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CARMIL1Q5VZK9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CARMIL1Q5VZK9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CARMIL1Q5VZK9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
CARMIL1Q5VZK9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CARMIL1Q5VZK9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CARMIL1Q5VZK9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC39.64■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
CARMIL1Q5VZK9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CARMIL1Q5VZK9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
CARMIL1Q5VZK9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CARMIL1Q5VZK9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CARMIL1Q5VZK9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CARMIL1Q5VZK9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CARMIL1Q5VZK9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CARMIL1Q5VZK9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
CARMIL1Q5VZK9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CARMIL1Q5VZK9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CARMIL1Q5VZK9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CARMIL1Q5VZK9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CARMIL1Q5VZK9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CARMIL1Q5VZK9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
CARMIL1Q5VZK9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CARMIL1Q5VZK9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC39.51■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC39.51■■■■□ 3.92
CARMIL1Q5VZK9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms