Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRRT3Q5FWE3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRRT3Q5FWE3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRRT3Q5FWE3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms