Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ16

PLA2G4E, Cytosolic phospholipase A2 epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4EQ3MJ16 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLA2G4EQ3MJ16 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLA2G4EQ3MJ16 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLA2G4EQ3MJ16 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLA2G4EQ3MJ16 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLA2G4EQ3MJ16 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLA2G4EQ3MJ16 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLA2G4EQ3MJ16 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLA2G4EQ3MJ16 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLA2G4EQ3MJ16 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLA2G4EQ3MJ16 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLA2G4EQ3MJ16 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLA2G4EQ3MJ16 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLA2G4EQ3MJ16 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLA2G4EQ3MJ16 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLA2G4EQ3MJ16 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLA2G4EQ3MJ16 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLA2G4EQ3MJ16 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLA2G4EQ3MJ16 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLA2G4EQ3MJ16 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms