Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD55Q3KP44 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms