Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTC1Q2NKJ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTC1Q2NKJ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTC1Q2NKJ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CTC1Q2NKJ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTC1Q2NKJ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTC1Q2NKJ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTC1Q2NKJ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTC1Q2NKJ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CTC1Q2NKJ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTC1Q2NKJ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTC1Q2NKJ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTC1Q2NKJ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms