Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCA4Q14CN2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCA4Q14CN2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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