Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
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