Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC2Q13868 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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