Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 RASGRP4-218ENST00000617966 2927 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.621e-11■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 RASGRP4-215ENST00000614135 2942 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.621e-11■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 RASGRP4-201ENST00000293062 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.621e-11■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 RASGRP4-205ENST00000586305 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.71e-11■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 RASGRP4-204ENST00000454404 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.731e-11■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 RASGRP4-214ENST00000592322 3313 ntTSL 510.1□□□□□ -0.791e-11■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 RASGRP4-219ENST00000618320 3313 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.791e-11■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 RASGRP4-220ENST00000622174 2651 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.81e-11■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 RASGRP4-202ENST00000426920 2650 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.81e-11■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.81e-11■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 RASGRP4-217ENST00000615439 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.831e-11■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 ACSM3-202ENST00000440284 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.871e-11■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 LINC01090-201ENST00000415357 881 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.881e-11■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 RASGRP4-216ENST00000615340 4074 ntTSL 59.32□□□□□ -0.921e-11■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 TMEM116-216ENST00000552800 485 ntTSL 39.03□□□□□ -0.961e-11■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 ACSM3-207ENST00000562251 1931 ntTSL 26.85□□□□□ -1.311e-11■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.71e-11■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.791e-11■■■■■ 37.8
TARDBPQ13148 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.573e-6■■■■■ 37.7
TARDBPQ13148 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 37.7
TARDBPQ13148 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 37.7
TARDBPQ13148 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.111e-10■■■■■ 37.7
TARDBPQ13148 THUMPD3-206ENST00000452837 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.51e-10■■■■■ 37.7
TARDBPQ13148 THUMPD3-201ENST00000345094 3961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.751e-10■■■■■ 37.7
TARDBPQ13148 THUMPD3-205ENST00000441127 708 ntTSL 26.85□□□□□ -1.311e-10■■■■■ 37.7
TARDBPQ13148 THUMPD3-202ENST00000416603 807 ntTSL 26.77□□□□□ -1.331e-10■■■■■ 37.7
TARDBPQ13148 THUMPD3-207ENST00000461636 670 ntTSL 25.72□□□□□ -1.491e-10■■■■■ 37.7
TARDBPQ13148 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC12.66□□□□□ -0.382e-8■■■■■ 37.7
TARDBPQ13148 AACSP1-201ENST00000503486 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.692e-8■■■■■ 37.7
TARDBPQ13148 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.463e-11■■■■■ 37.7
TARDBPQ13148 WWP2-218ENST00000569620 738 ntTSL 511.89□□□□□ -0.513e-11■■■■■ 37.7
TARDBPQ13148 WWP2-203ENST00000544162 2723 ntTSL 210.67□□□□□ -0.73e-11■■■■■ 37.7
TARDBPQ13148 WWP2-216ENST00000569174 2474 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.873e-11■■■■■ 37.7
TARDBPQ13148 WWP2-211ENST00000567986 547 ntTSL 45.23□□□□□ -1.573e-11■■■■■ 37.7
TARDBPQ13148 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.653e-11■■■■■ 37.7
TARDBPQ13148 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.243e-11■■■■■ 37.7
TARDBPQ13148 BLCAP-213ENST00000467603 439 ntTSL 316.01■□□□□ 0.153e-11■■■■■ 37.7
TARDBPQ13148 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.193e-11■■■■■ 37.7
TARDBPQ13148 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.075e-9■■■■■ 37.6
TARDBPQ13148 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.042e-16■■■■■ 37.6
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TARDBPQ13148 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.198e-7■■■■■ 37.6
TARDBPQ13148 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.098e-7■■■■■ 37.6
TARDBPQ13148 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.668e-7■■■■■ 37.6
TARDBPQ13148 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.548e-7■■■■■ 37.6
TARDBPQ13148 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.448e-7■■■■■ 37.6
TARDBPQ13148 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.448e-7■■■■■ 37.6
TARDBPQ13148 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.388e-7■■■■■ 37.6
TARDBPQ13148 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.118e-7■■■■■ 37.6
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TARDBPQ13148 TOP3A-201ENST00000321105 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.711e-9■■■■■ 37.6
TARDBPQ13148 TOP3A-214ENST00000582981 3239 ntTSL 210.19□□□□□ -0.781e-9■■■■■ 37.6
TARDBPQ13148 TOP3A-209ENST00000580095 2929 ntTSL 1 (best)9.94□□□□□ -0.821e-9■■■■■ 37.6
TARDBPQ13148 TOP3A-208ENST00000542570 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.851e-9■■■■■ 37.6
TARDBPQ13148 TOP3A-203ENST00000469739 3196 ntTSL 28.9□□□□□ -0.981e-9■■■■■ 37.6
TARDBPQ13148 QKI-210ENST00000537883 1106 ntTSL 38.97□□□□□ -0.978e-8■■■■■ 37.6
TARDBPQ13148 QKI-215ENST00000544823 597 ntTSL 24.96□□□□□ -1.628e-8■■■■■ 37.6
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TARDBPQ13148 AGPAT4-201ENST00000320285 7865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.914e-7■■■■■ 37.4
TARDBPQ13148 AGPAT3-208ENST00000448287 454 ntTSL 311.41□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 37.4
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TARDBPQ13148 GRAMD1A-213ENST00000603669 552 ntTSL 515.84■□□□□ 0.131e-9■■■■■ 37.4
TARDBPQ13148 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.211e-9■■■■■ 37.4
TARDBPQ13148 GRAMD1A-206ENST00000598073 582 ntTSL 311.24□□□□□ -0.611e-9■■■■■ 37.4
TARDBPQ13148 GRAMD1A-204ENST00000594597 567 ntTSL 410.38□□□□□ -0.751e-9■■■■■ 37.4
TARDBPQ13148 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.795e-7■■■■■ 37.3
TARDBPQ13148 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 37.3
TARDBPQ13148 AGPAT3-209ENST00000448845 392 ntTSL 510.34□□□□□ -0.756e-7■■■■■ 37.3
TARDBPQ13148 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.369e-7■■■■■ 37.3
TARDBPQ13148 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.229e-7■■■■■ 37.3
TARDBPQ13148 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.419e-7■■■■■ 37.3
TARDBPQ13148 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.774e-7■■■■■ 37.2
TARDBPQ13148 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.62e-10■■■■■ 37.2
TARDBPQ13148 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.52e-10■■■■■ 37.2
TARDBPQ13148 AK2-215ENST00000629371 3576 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.672e-10■■■■■ 37.2
TARDBPQ13148 AK2-202ENST00000373449 3586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.772e-10■■■■■ 37.2
TARDBPQ13148 UBE3A-214ENST00000627018 474 ntTSL 320.05■□□□□ 0.83e-11■■■■■ 37.2
TARDBPQ13148 SCHLAP1-201ENST00000629145 1436 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.126e-10■■■■■ 37.2
TARDBPQ13148 PPP2R5C-203ENST00000350249 3845 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.683e-7■■■■■ 37.1
TARDBPQ13148 PPP2R5C-202ENST00000334743 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.83e-7■■■■■ 37.1
TARDBPQ13148 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.283e-7■■■■■ 37.1
TARDBPQ13148 PPP2R5C-229ENST00000557621 759 ntTSL 55.88□□□□□ -1.473e-7■■■■■ 37.1
TARDBPQ13148 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.563e-7■■■■■ 37.1
TARDBPQ13148 ASIC4-205ENST00000474489 2403 ntTSL 1 (best)16.34■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 37.1
TARDBPQ13148 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.062e-8■■■■■ 37.1
TARDBPQ13148 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.082e-8■■■■■ 37.1
TARDBPQ13148 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.167e-7■■■■■ 37.1
TARDBPQ13148 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.467e-7■■■■■ 37.1
TARDBPQ13148 GATAD2A-207ENST00000432704 570 ntTSL 417.85■□□□□ 0.452e-9■■■■■ 37.1
TARDBPQ13148 ZNF692-220ENST00000496411 1064 ntTSL 320.95■□□□□ 0.942e-20■■■■■ 37
TARDBPQ13148 ZNF692-212ENST00000478107 1051 ntTSL 520.63■□□□□ 0.892e-20■■■■■ 37
TARDBPQ13148 ZNF692-207ENST00000468455 644 ntTSL 518.04■□□□□ 0.482e-20■■■■■ 37
TARDBPQ13148 ZNF692-214ENST00000483223 901 ntTSL 317.82■□□□□ 0.442e-20■■■■■ 37
TARDBPQ13148 ZNF692-216ENST00000491971 805 ntTSL 212.76□□□□□ -0.372e-20■■■■■ 37
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