Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP4Q13115 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP4Q13115 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP4Q13115 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms