Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1BQ13112 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAF1BQ13112 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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