Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RELAQ04206 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RELAQ04206 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RELAQ04206 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RELAQ04206 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RELAQ04206 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RELAQ04206 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RELAQ04206 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RELAQ04206 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RELAQ04206 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RELAQ04206 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RELAQ04206 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RELAQ04206 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RELAQ04206 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RELAQ04206 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RELAQ04206 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RELAQ04206 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RELAQ04206 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RELAQ04206 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RELAQ04206 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RELAQ04206 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RELAQ04206 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RELAQ04206 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RELAQ04206 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RELAQ04206 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RELAQ04206 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RELAQ04206 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RELAQ04206 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RELAQ04206 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RELAQ04206 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RELAQ04206 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RELAQ04206 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RELAQ04206 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RELAQ04206 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RELAQ04206 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RELAQ04206 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RELAQ04206 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RELAQ04206 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RELAQ04206 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RELAQ04206 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RELAQ04206 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RELAQ04206 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RELAQ04206 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RELAQ04206 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RELAQ04206 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RELAQ04206 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RELAQ04206 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RELAQ04206 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RELAQ04206 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RELAQ04206 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RELAQ04206 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RELAQ04206 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RELAQ04206 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RELAQ04206 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RELAQ04206 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RELAQ04206 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RELAQ04206 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RELAQ04206 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RELAQ04206 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RELAQ04206 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RELAQ04206 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RELAQ04206 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RELAQ04206 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RELAQ04206 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RELAQ04206 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RELAQ04206 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RELAQ04206 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RELAQ04206 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RELAQ04206 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RELAQ04206 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RELAQ04206 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RELAQ04206 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RELAQ04206 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RELAQ04206 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RELAQ04206 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RELAQ04206 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RELAQ04206 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RELAQ04206 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RELAQ04206 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RELAQ04206 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RELAQ04206 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RELAQ04206 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RELAQ04206 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RELAQ04206 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RELAQ04206 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RELAQ04206 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RELAQ04206 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RELAQ04206 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RELAQ04206 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RELAQ04206 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RELAQ04206 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RELAQ04206 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RELAQ04206 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RELAQ04206 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RELAQ04206 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RELAQ04206 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RELAQ04206 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RELAQ04206 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RELAQ04206 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RELAQ04206 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms