Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MC1RQ01726 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MC1RQ01726 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.9 ms