Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERVFC1P60507 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVFC1P60507 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVFC1P60507 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVFC1P60507 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms