Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN2P57739 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN2P57739 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN2P57739 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms