Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMP3P54852 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMP3P54852 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMP3P54852 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMP3P54852 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMP3P54852 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMP3P54852 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMP3P54852 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMP3P54852 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMP3P54852 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMP3P54852 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMP3P54852 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EMP3P54852 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMP3P54852 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMP3P54852 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMP3P54852 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMP3P54852 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMP3P54852 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMP3P54852 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMP3P54852 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMP3P54852 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMP3P54852 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMP3P54852 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMP3P54852 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMP3P54852 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMP3P54852 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMP3P54852 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMP3P54852 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMP3P54852 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EMP3P54852 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMP3P54852 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMP3P54852 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMP3P54852 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EMP3P54852 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMP3P54852 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMP3P54852 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMP3P54852 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMP3P54852 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMP3P54852 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EMP3P54852 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMP3P54852 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMP3P54852 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMP3P54852 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMP3P54852 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMP3P54852 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMP3P54852 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMP3P54852 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMP3P54852 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMP3P54852 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMP3P54852 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMP3P54852 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMP3P54852 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMP3P54852 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMP3P54852 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMP3P54852 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMP3P54852 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMP3P54852 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMP3P54852 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMP3P54852 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
EMP3P54852 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMP3P54852 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMP3P54852 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMP3P54852 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMP3P54852 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMP3P54852 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMP3P54852 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMP3P54852 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMP3P54852 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMP3P54852 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMP3P54852 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMP3P54852 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMP3P54852 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EMP3P54852 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMP3P54852 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMP3P54852 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMP3P54852 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMP3P54852 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMP3P54852 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMP3P54852 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMP3P54852 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMP3P54852 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMP3P54852 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMP3P54852 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMP3P54852 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMP3P54852 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMP3P54852 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMP3P54852 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMP3P54852 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMP3P54852 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMP3P54852 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMP3P54852 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMP3P54852 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMP3P54852 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMP3P54852 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMP3P54852 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMP3P54852 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMP3P54852 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMP3P54852 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EMP3P54852 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EMP3P54852 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms