Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSEN1P49768 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSEN1P49768 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms