Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFHR2P36980 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFHR2P36980 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFHR2P36980 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms